Sademete seire eesmärk on jälgida õhu kaudu keskkonda jõudvate saasteainete koostist, kogust ja võimalikke mõjusid eri piirkondades üle Eesti. Seiret tehakse alates 1995. aastast enam kui kahekümnes jaamas ja alal, hõlmates nii tausta-, linna- kui ka metsaseire alasid.

Välisõhu kvaliteedi seire eesmärk on jälgida õhusaaste taset nii linnades kui ka looduslikel taustaaladel, et hinnata saasteainete mõju inimeste tervisele ja keskkonnale. Eestis toimuvad pidevad mõõtmised kuues linnaõhu- ja kolmes taustaseirejaamas.

Siseveekogude – jõgede ja järvede – seire eesmärk on hinnata veekogude ökoloogilist ja keemilist seisundit ning jälgida muutusi, mida põhjustavad nii inimtegevus kui looduslikud protsessid. Seire tulemused aitavad mõista vee kvaliteeti ja elustiku seisundit ning kujundada keskkonnakaitsemeetmeid.

Seismilise seire eesmärk on jälgida ja analüüsida Eestis ja selle lähialadel toimuvaid maavärinaid ja muid maakoores esinevaid liikumisi. Selleks kasutatakse mitmeid seismojaamu üle Eesti ning andmeid ka naaberriikide jaamadest. Seire aitab mõista seismilise aktiivsuse mustreid ja teavitada avalikkust võimalike sündmuste taustast.

Kiirgusseire eesmärk on avastada ja jälgida ioniseeriva kiirguse tasemeid Eesti keskkonnas, keskendudes eelkõige inimtegevusest pärineva radioaktiivsuse võimalikele allikatele ja levikule. Seire annab olulist teavet keskkonna ja elanikkonna kiirgusohutuse hindamiseks.